Лук-батун наиболее широко распространен среди многолетних луков. Несмотря на то что этот вид может выращиваться в многолетней культуре, по циклу своего развития он двулетник, так как в первый год из семян за период вегетации вырастает растение, состоящее из 1...2 ветвей, а на второй год это растение дает 1...3 стрелки. В последующие годы репродуктивные органы появляются в количестве, соответствующем числу ветвей.

Стрелка батуна достигает высоты 30...40 см; она полая, со вздутием в средней части, благодаря чему устойчива против ветра. Толщина стрелки в наиболее широкой ее части 2...3,5 см. Стрелка зеленая, поэтому является дополнительным органом фотосинтеза, обеспечивающим питание цветков и семян. Число цветков в одном соцветии достигает 150...250. Цветки собраны в простой зонтик.

Цветок состоит из 6 лепестков, 6 тычинок и одного простого пестика, который вначале возвышается над тычинками, затем перед растрескиванием пыльников находится на одном уровне с последними. Венчик белый, на наружной стороне вдоль лепестков проходит зеленая полоска. Диаметр соцветия 4...5 см.
В сочных чешуях луковицы содержатся запасные питательные вещества, которые обеспечивают питание генеративных и вегетативных почек на следующий год.

От каждой ветви (ложной луковицы) отходят 3...5 листьев, которые у лука-батуна можно срезать в период вегетации 2...3 раза, но с таким расчетом, чтобы последняя срезка была не позднее чем за 2 мес до окончательных холодов. Это необходимо для того, чтобы листья могли образовать достаточное количество пластических веществ, которые накапливаются в луковице — запасающем органе. Поздняя срезка ослабляет растения, вследствие чего они в большинстве случаев плохо перезимовывают. Особенно важно не истощать растения в районах с недостаточным снеговым покровом при сильных морозах.